学校现有博士后科研流动站8个，分别为“动力工程及工程热物理”、“管理科学与工程”、“光学工程”、“生物医学工程”、“系统科学”、“机械工程”、“控制科学与工程”和“食品科学与工程”。
“动力工程及工程热物理”博士后科研流动站成立于1991年，“动力工程及工程热物理”一级博士点涵盖工程热物理、热能工程、动力机械与工程、流体机械及工程、制冷及低温技术、化工过程机械等6个二级学科博士点，涵盖相应学科领域及研究方向。
“管理科学与工程”博士后科研流动站成立于2003年，“管理科学与工程”一级学科博士点涵盖系统工程与管理科学、交通与物流工程、工业工程与先进制造、科技管理、管理工程与企业管理、金融系统工程、教育系统工程、信息管理等学科领域及研究方向。
“光学工程”博士后科研流动站成立于2007年，“光学工程”一级学科博士点涵盖光电子技术、光电检测技术、光学仪器、光纤通讯技术、生物医学光学与视觉光学、印刷光学工程、微光机电系统等学科领域及研究方向。
“生物医学工程”博士后科研流动站成立于2014年，“生物医学工程”一级学科博士点涵盖微创医疗器械及技术、低温生物医学工程、生物医学信息及处理、生物医学光学等四个二级学科博士点，涵盖相应学科领域及研究方向。
“系统科学”博士后科研流动站成立于2019年，“系统科学”一级学科博士点涵盖系统分析优化控制、系统生物学、复杂系统理论、网络计算与并行计算、并行复杂网络算法等学科领域及研究方向。
“机械工程”博士后科研流动站成立于2019年，“机械工程”一级博士点涵盖机械制造及其自动化、机械电子工程、机械设计及理论、车辆工程等4个二级学科博士点，涵盖相应学科领域及研究方向。
“控制科学与工程学科” 博士后科研流动站成立于2023年，“控制科学与工程”一级学科博士点覆盖控制理论与控制工程、检测技术与自动装置 、模式识别与智能系统、自主智能系统理论及应用等领域的科学研究，聚焦网络化系统的控制与滤波、智能机器人、能源调度、人机交互与情感计算、医学图像处理、工业大数据等研究方向。
“食品科学与工程”博士后科研流动站成立于2023年，“食品科学与工程”一级学科博士点涵盖食品营养与健康、食品质量与安全控制、食品冷冻与冷藏、食品加工与装备等学科领域及研究方向。
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